MN08: Różnice pomiędzy wersjami
Nie podano opisu zmian |
Nie podano opisu zmian |
||
Linia 1: | Linia 1: | ||
<!-- | |||
Konwertowane z pliku LaTeX przez latex2mediawiki, zob. http://www.ii.uj.edu.pl/ pawlik1/latex2mediawiki.php. | |||
Niezb�dne rozszerzenia i modyfikacje oryginalnego latex2mediawiki | |||
wprowadzi� przykry@mimuw.edu.pl | |||
--> | |||
=Wielkie układy równań liniowych= | =Wielkie układy równań liniowych= | ||
{{powrot |Metody numeryczne | do strony głównej | |||
przedmiotu <strong>Metody numeryczne</strong>}} | |||
Wraz z coraz większymi modelami pojawiającymi się w praktyce obliczeniowej, | Wraz z coraz większymi modelami pojawiającymi się w praktyce obliczeniowej, | ||
Linia 11: | Linia 21: | ||
stały się rozwiązywalne przy obecnym stanie techniki obliczeniowej! | stały się rozwiązywalne przy obecnym stanie techniki obliczeniowej! | ||
Jednym ze szczególnie ważnych źródeł układów równań z macierzami rozrzedzonymi | Jednym ze szczególnie ważnych źródeł układów równań z macierzami rozrzedzonymi są np. <strong>równania różniczkowe cząstkowe</strong> (a więc np. modele pogody, naprężeń w konstrukcji samochodu, przenikania kosmetyków do głębszych warstw skóry, itp.). | ||
są np. | |||
konstrukcji samochodu, przenikania kosmetyków do głębszych warstw skóry, itp.). | Modele wielostanowych systemów kolejkowych (np. routera obsługującego wiele komputerów) także prowadzą do gigantycznych układów równań z macierzami rozrzedzonymi o specyficznej strukturze. | ||
Z reguły zadania liniowe ''wielkiego wymiaru'' będą miały strukturę macierzy rozrzedzonej, gdyż najczęściej związki pomiędzy niewiadomymi w równaniu nie dotyczą wszystkich, tylko wybranej grupy. | |||
<div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | <div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | ||
<span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Macierz z kolekcji Boeinga</span> | <span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Macierz z kolekcji Boeinga</span> | ||
<div class="solution"> | <div class="solution" style="margin-left,margin-right:3em;"> | ||
Spójrzmy na macierz sztywności dla modelu silnika lotniczego, wygenerowaną swego czasu w zakładach Boeinga i pochodzącą z dyskretyzacji pewnego równania różniczkowego cząstkowego. Pochodzi z [http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/matrices/Boeing kolekcji Tima Davisa]. Jest to mała macierz, wymiaru 8032 (w kolekcji spotkasz równania z milionem i więcej niewiadomych). | |||
zakładach Boeinga | |||
[http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/matrices/Boeing kolekcji Tima | |||
Davisa] | |||
Jest to mała macierz, wymiaru 8032 (w kolekcji spotkasz równania z milionem i | |||
więcej | |||
niewiadomych). | |||
[[Image:MNsparseA.png|thumb| | [[Image:MNsparseA.png|thumb|550px|center|Struktura niezerowych elementów macierzy bcsstk38.]] | ||
Jej <strong>współczynnik wypełnienia</strong> (to znaczy, stosunek liczby niezerowych do wszystkich elementów macierzy) wynosi jedynie <math>\displaystyle 0.006</math>, a więc macierz jest bardzo rozrzedzona: w każdym wierszu są średnio tylko 44 niezerowe elementy. | |||
</div></div> | </div></div> | ||
<!-- | |||
<div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | <div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | ||
<span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Macierz MBEACXC</span> | <span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Macierz MBEACXC</span> | ||
<div class="solution"> | <div class="solution" style="margin-left,margin-right:3em;"> | ||
Dane pochodzą z serwisu | Dane pochodzą z serwisu | ||
[http://math.nist.gov/MatrixMarket MatrixMarket]. Jest to niezbyt duża macierz, wymiaru | [http://math.nist.gov/MatrixMarket MatrixMarket]. Jest to niezbyt duża macierz, wymiaru <math>\displaystyle 496 \times 496</math>, niesymetryczna, o elementach rzeczywistych. Źródłem tej macierzy jest pewien model ekonomiczny. | ||
<math>\displaystyle 496 \times 496</math>, niesymetryczna, o elementach rzeczywistych. Źródłem tej | |||
macierzy jest pewien model ekonomiczny. | |||
[[Image:MNmbeacxc|thumb| | [[Image:MNmbeacxc|thumb|550px|center|Struktura niezerowych elementów macierzy MBEACXC]] | ||
Tylko pozornie macierz ta wydaje się dość gęsta, w rzeczywistości jej współczynnik wypełnienia | Tylko pozornie macierz ta wydaje się dość gęsta, w rzeczywistości jej współczynnik wypełnienia wynosi około 20 procent. | ||
wynosi około 20 procent. | |||
</div></div> | </div></div> | ||
== | --> | ||
==Reprezentacja macierzy rzadkich== | |||
Zacznijmy od sposobu przechowywania macierzy rozrzedzonych. Naturalnie, nie ma | Zacznijmy od sposobu przechowywania macierzy rozrzedzonych. Naturalnie, nie ma | ||
Linia 63: | Linia 63: | ||
wektor, nie będziemy mnożyć przez zera!). | wektor, nie będziemy mnożyć przez zera!). | ||
===Format współrzędnych=== | |||
Do zapamiętania macierzy | Do zapamiętania macierzy <math>\displaystyle A</math> wymiaru <math>\displaystyle N\times M</math> o <math>\displaystyle NNZ</math> niezerowych elementów wykorzystujemy trzy wektory: <code>I</code>, | ||
<math>\displaystyle A</math> wymiaru <math>\displaystyle N\times M</math> o <math>\displaystyle NNZ</math> niezerowych elementów wykorzystujemy trzy wektory: <code>I</code>, | |||
<code>J</code> --- oba typu <code>int</code> --- oraz <code>V</code>, typu <code>double</code>, | <code>J</code> --- oba typu <code>int</code> --- oraz <code>V</code>, typu <code>double</code>, | ||
wszystkie o długości <math>\displaystyle NNZ</math>, przy czym | wszystkie o długości <math>\displaystyle NNZ</math>, przy czym | ||
Linia 74: | Linia 73: | ||
</math></center> | </math></center> | ||
[[Image:MNaij-matrix-format.png|thumb| | [[Image:MNaij-matrix-format.png|thumb|550px|center|Format AIJ]] | ||
W tym formacie wprowadzane są macierze rzadkie do Octave'a i MATLABa: | W tym formacie wprowadzane są macierze rzadkie do Octave'a i MATLABa: | ||
<div | <div style="margin: 1em; padding:1em; color: #006; background-color:#fcfcfc;"><pre>A = sparse(I,J,V,N,N); | ||
</pre></div> | |||
A = sparse(I,J,V,N,N); | Jednak wewnętrznie przechowywane są w innym formacie, o którym [[#Format spakowanych kolumn (wierszy)|poniżej]]. | ||
</ | |||
<div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | |||
<span style="font-variant:small-caps;">Przykład</span> | |||
<div class="solution" style="margin-left,margin-right:3em;"> | |||
Pokażemy jak w Octave wprowadzić macierz rozrzedzoną. | |||
<div style="font-family: monospace; white-space: pre; border-style: dashed; border-width: thin; border-color: black; margin: 1em; padding:1em; color: #444; background-color:#fdfdfd;"><nowiki>octave:10> I = [1, 1, 1, 2, 3, 1, 4]; | |||
octave:11> J = [1, 3, 2, 2, 3, 4, 4]; | |||
octave:12> V = [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7]; | |||
octave:13> N = 4; | |||
octave:14> A = sparse(I,J,V,N,N) | |||
A = | |||
Compressed Column Sparse (rows = 4, cols = 4, nnz = 7) | |||
(1, 1) -> 1 | |||
(1, 2) -> 3 | |||
(2, 2) -> 4 | |||
(1, 3) -> 2 | |||
(3, 3) -> 5 | |||
(1, 4) -> 6 | |||
(4, 4) -> 7 | |||
octave:15> spy(A); | |||
</nowiki></div> | |||
====Format spakowanych kolumn (wierszy) | Strukturę jej niezerowych elementów ukaże nam polecenie <code style="color: #006">spy(A)</code>. Tak właśnie zostały wygenerowane obrazki macierzy w niniejszym wykładzie. | ||
</div></div> | |||
===Format spakowanych kolumn (wierszy)=== | |||
Format współrzędnych nie narzucał żadnego uporządkowania elementów macierzy | Format współrzędnych nie narzucał żadnego uporządkowania elementów macierzy | ||
Linia 89: | Linia 118: | ||
porządku mogłoby wspomóc realizację wybranych istotnych operacji na macierzy, | porządku mogłoby wspomóc realizację wybranych istotnych operacji na macierzy, | ||
na przykład, aby wygodnie było realizować działanie (prawostronnego) mnożenia | na przykład, aby wygodnie było realizować działanie (prawostronnego) mnożenia | ||
macierzy przez wektor, | macierzy przez wektor, dobrze byłoby przechowywać elementy macierzy ''wierszami''. Tak właśnie jest zorganizowany format spakowanych wierszy (''Compressed Sparse Row, CSR''). Analogicznie jest zdefiniowany format | ||
''Compressed Sparse Row | spakowanych kolumn (''Compressed Sparse Column, CSC''), którym zajmiemy się bliżej. | ||
spakowanych kolumn | |||
''Compressed Sparse Column | |||
Podobnie jak w przypadku formatu współrzędnych, macierz w formacie CSC jest | Podobnie jak w przypadku formatu współrzędnych, macierz w formacie CSC jest | ||
Linia 101: | Linia 128: | ||
elementom z <code>AV</code>. Natomiast zamiast tablicy <code>J</code>, jak to było w | elementom z <code>AV</code>. Natomiast zamiast tablicy <code>J</code>, jak to było w | ||
formacie współrzędnych, mamy krótszy wektor typu <code>int</code>, <code>AP</code>, o | formacie współrzędnych, mamy krótszy wektor typu <code>int</code>, <code>AP</code>, o | ||
długości <math>\displaystyle M</math> zawierający na <math>\displaystyle j</math>-tym miejscu indeks pozycji w <code>AV</code>, od | długości <math>\displaystyle M</math>, zawierający na <math>\displaystyle j</math>-tym miejscu indeks pozycji w <code>AV</code>, od | ||
którego rozpoczynają się w <code>AV</code> elementy <math>\displaystyle j</math>-tej kolumny macierzy <math>\displaystyle A</math>. | którego rozpoczynają się w <code>AV</code> elementy <math>\displaystyle j</math>-tej kolumny macierzy <math>\displaystyle A</math>. | ||
[[Image:MNcsc-matrix-format.png|thumb| | [[Image:MNcsc-matrix-format.png|thumb|550px|center|Format CSC]] | ||
Mamy więc zależność, przy założeniu, że <math>\displaystyle AP[0]=0</math>, | Mamy więc zależność, przy założeniu, że <math>\displaystyle AP[0]=0</math>, | ||
Linia 113: | Linia 140: | ||
Taki (z drobnymi modyfikacjami) format macierzy wykorzystują np. pakiety ARPACK | Taki (z drobnymi modyfikacjami) format macierzy wykorzystują np. pakiety ARPACK | ||
i UMFPACK. | i UMFPACK (a także, wewnętrznie, Octave i MATLAB). | ||
===Format diagonalny=== | |||
Znacznie mniej uniwersalny niż poprzednie i dlatego rzadziej spotykany. Kolejne | Znacznie mniej uniwersalny niż poprzednie i dlatego rzadziej spotykany. Kolejne | ||
Linia 122: | Linia 149: | ||
Szczególnie wygodny do reprezentacji macierzy taśmowych. Wykorzystywany m.in. | Szczególnie wygodny do reprezentacji macierzy taśmowych. Wykorzystywany m.in. | ||
przez funkcję LAPACKa <code>DGBSV</code> służącą rozwiązywaniu równań z macierzami | przez funkcję LAPACKa <code style="color: #903">DGBSV</code> służącą rozwiązywaniu równań z macierzami | ||
taśmowymi. | taśmowymi. | ||
===Uwagi praktyczne=== | |||
Mnożenie macierzy w formacie AIJ przez wektor jest kilka razy wolniejsze w porównaniu do macierzy w formacie CSC/CSR (z tych dwóch oczywiście (dlaczego?) CSR jest najszybszy). Co więcej, okazuje się, że w typowych implementacjach, mnożenie macierzy rozrzedzonej (reprezentowanej np. w formacie CSC) przez wektor jest mało efektywne, mniej więcej na poziomie dziesięciu procent możliwości obliczeniowych procesora. | |||
Jeśli już ''poważnie'' myśleć o przyspieszeniu mnożenia macierzy przez wektor (np. gdy chcemy stosować [[#Stacjonarne metody iteracyjne|iteracyjną metodę rozwiązywania układu równań]] z tą macierzą), warto rozważyć [http://bebop.cs.berkeley.edu/pubs/vuduc2003-dissertation.pdf inne formaty] --- łączące w sobie podział macierzy na bloki (tak, jak w algorytmach BLAS) i przechowywanie (w zasadzie) tylko niezerowych elementów macierzy. | |||
==Macierze specjalne== | ==Macierze specjalne== | ||
Linia 139: | Linia 172: | ||
wyspecjalizowane algorytmy. | wyspecjalizowane algorytmy. | ||
===Macierze taśmowe=== | |||
Macierz <math>\displaystyle A</math> taka, że dla <math>\displaystyle |i-j| \geq d</math>, <math>\displaystyle a_{ij} = 0</math>, nazywamy macierzą taśmową | Macierz <math>\displaystyle A</math> taka, że dla <math>\displaystyle |i-j| \geq d</math>, <math>\displaystyle a_{ij} = 0</math>, nazywamy macierzą taśmową | ||
Linia 152: | Linia 185: | ||
W szczególności, gdy macierz jest taśmowa z pasmem o rozstępie <math>\displaystyle d</math> i jednocześnie | W szczególności, gdy macierz jest taśmowa z pasmem o rozstępie <math>\displaystyle d</math> i jednocześnie | ||
diagonalnie dominująca, wtedy rozkład LU takiej macierzy da się wykonać w | diagonalnie dominująca, wtedy rozkład LU takiej macierzy da się wykonać w | ||
miejscu kosztem <math>\displaystyle O(d\,N)</math> czyli liniowym. | miejscu kosztem <math>\displaystyle O(d\,N)</math>, czyli liniowym. | ||
W LAPACKu zaimplementowano szybki solver równań z macierzami taśmowymi, | W [http://www.netlib.org/lapack LAPACKu] zaimplementowano szybki ''solver'' równań z macierzami taśmowymi, | ||
<code>DGBSV</code> wymagający | <code style="color: #903">DGBSV</code>, ale wymagający specjalnego sposobu | ||
przechowywania macierzy | przechowywania macierzy, wykorzystującego format diagonalny. | ||
===Macierze trójdiagonalne=== | |||
Szczególnym przypadkiem macierzy taśmowych są macierze trójdiagonalne, tzn. taśmowe o | Szczególnym przypadkiem macierzy taśmowych są macierze trójdiagonalne, tzn. taśmowe o | ||
Linia 179: | Linia 212: | ||
</math></center> | </math></center> | ||
jest | jest bardzo często spotykane, więc warto przytoczyć algorytm w całej okazałości --- popularnie zwany <strong>algorytmem przeganiania</strong> (niektóre źródła nazywają go ''algorytmem Thomasa''). | ||
warto przytoczyć algorytm w całej okazałości --- popularnie zwany algorytmem | |||
przeganiania. | |||
Zacznijmy jednak od stwierdzenia, kiedy | Zacznijmy jednak od stwierdzenia, kiedy macierz trójdiagonalna nie wymaga wyboru elementu głównego: | ||
głównego: | |||
{{stwierdzenie||| | {{stwierdzenie||| | ||
Jeśli macierz <math>\displaystyle A</math> ma <strong>słabo</strong> | Jeśli macierz <math>\displaystyle A</math> ma <strong>słabo dominującą diagonalę</strong>, tzn. | ||
<center><math>\displaystyle |a_i|\,\ge\,|b_i|\,+\,|c_i|,\qquad 1\le i\le N, | <center><math>\displaystyle |a_i|\,\ge\,|b_i|\,+\,|c_i|,\qquad 1\le i\le N, | ||
Linia 198: | Linia 228: | ||
}} | }} | ||
{{algorytm|Metoda przeganiania|| | {{algorytm|Metoda przeganiania|Metoda przeganiania| | ||
<pre> | <pre><math>\displaystyle d_1</math> = <math>\displaystyle a_1</math>; | ||
<math>\displaystyle d_1</math> = <math>\displaystyle a_1</math>; | |||
<math>\displaystyle f_1</math> = <math>\displaystyle e_1</math>; | <math>\displaystyle f_1</math> = <math>\displaystyle e_1</math>; | ||
for (i = 2; i <= N; i++) | for (i = 2; i <= N; i++) | ||
Linia 218: | Linia 246: | ||
<div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | <div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | ||
<span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Strzałka Wilkinsona</span> | <span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Strzałka Wilkinsona</span> | ||
<div class="solution"> | <div class="solution" style="margin-left,margin-right:3em;"> | ||
Rozważmy układ równań z macierzą diagonalnie dominującą postaci | Rozważmy układ równań z macierzą diagonalnie dominującą postaci | ||
Linia 248: | Linia 276: | ||
</math></center> | </math></center> | ||
Wtedy okazuje się, że rozkład naszej macierzy nie powoduje już | Wtedy okazuje się, że rozkład naszej macierzy nie powoduje już ''wypełnienia'' czynników rozkładu! | ||
czynników rozkładu! | |||
</div></div> | </div></div> | ||
Właśnie na tym polega główny problem w rozwiązywaniu układów z macierzami | Właśnie na tym polega główny problem w rozwiązywaniu układów z macierzami | ||
rzadkimi metodami bezpośrednimi: maksymalnie wykorzystać rozrzedzenie macierzy | rzadkimi metodami bezpośrednimi: jak maksymalnie wykorzystać rozrzedzenie macierzy tak, by czynniki rozkładu były możliwie mało wypełnione. Albowiem wiedząc to będziemy mogli ograniczyć się jedynie do fizycznego wyznaczenia wartości <strong>niezerowych</strong> elementów macierzy rozkładu. Ponadto wymagania pamięciowe algorytmu nie będą istotnie wykraczać ponad ilość pamięci potrzebnej na przechowanie danych (tzn. macierzy). | ||
tak, by czynniki rozkładu były możliwie mało wypełnione. Albowiem wiedząc to | |||
będziemy mogli ograniczyć się jedynie do fizycznego wyznaczenia wartości <strong>niezerowych</strong> elementów macierzy rozkładu. Ponadto wymagania pamięciowe | |||
algorytmu nie będą istotnie wykraczać ponad ilość pamięci potrzebnej na przechowanie | |||
danych (macierzy). | |||
W ogólnym przypadku rozwiązanie takiego zadania jest trudne i większość | W ogólnym przypadku rozwiązanie takiego zadania jest trudne i większość | ||
algorytmów opiera się na pewnych heurystykach, które warto wspomóc wcześniejszą | algorytmów opiera się na pewnych heurystykach, które jednak w praktyce warto wspomóc wcześniejszą analizą konkretnego układu równań jaki mamy rozwiązać. Najczęściej dąży się do takiego przenumerowania równań i niewiadomych, by w efekcie z góry przewidzieć, gdzie wystąpią zera w macierzach rozkładu --- i, by takich zer było jak najwięcej (by wypełnienie było jak najmniejsze)! Na architekturach z pamięcią hierarchiczną dąży się także do tego, by w trakcie rozkładu można było korzystać z BLAS Level 3, a więc permutacje wierszy i kolumn macierzy muszą to także brać pod uwagę. | ||
analizą konkretnego układu równań | |||
takiego przenumerowania równań i niewiadomych, by w efekcie z góry przewidzieć, | |||
gdzie wystąpią zera w macierzach rozkładu --- i, by takich zer było jak | |||
najwięcej (by wypełnienie było jak najmniejsze)! Na architekturach z pamięcią | |||
hierarchiczną dąży się także do tego, by w trakcie rozkładu można było korzystać | |||
z | |||
uwagę | |||
Stosuje się kilka strategii wyznaczania korzystnych permutacji | Stosuje się kilka strategii wyznaczania korzystnych permutacji | ||
''reorderingu '', z których warto wymienić | (''reorderingu''), z których warto wymienić | ||
* przybliżone algorytmy minimalnego stopnia ''approximate minimum degree | * przybliżone algorytmy minimalnego stopnia (''approximate minimum degree, AMD''), np. [http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/amd AMD]; | ||
* techniki | * techniki podziału grafów na (prawie) rozłączne składowe ''nested dissection, ND'', np. [http://glaros.dtc.umn.edu/gkhome/views/metis METIS]. | ||
podziału grafów na (prawie) rozłączne składowe | |||
Używają ich biblioteki | Używają ich biblioteki takie jak [http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/umfpack UMFPACK], czy [http://www.cse.clrc.ac.uk/nag/hsl HSL]. | ||
takie jak [http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/umfpack UMFPACK], czy [http://www.cse.clrc.ac.uk/nag/hsl HSL]. | |||
W Octave mamy do dyspozycji także kilka procedur generujących takie permutacje, | W Octave mamy do dyspozycji także kilka procedur generujących takie permutacje, w tym: <code style="color: #006">colamd</code> (AMD dla macierzy niesymetrycznych) oraz <code style="color: #006">symamd</code> (AMD dla macierzy symetrycznych). Większy wybór oferuje MATLAB, jednak należy bezwzględnie pamiętać o jednym: nie ma uniwersalnej metody ''reorderingu'' i dla konkretnej macierzy może istnieć specjalna metoda, która da oszałamiające rezultaty, podczas gdy standardowe podejścia nie dadzą efektu. | ||
w tym: <code>colamd</code> (AMD dla macierzy niesymetrycznych) oraz <code>symamd</code> | |||
(AMD dla macierzy symetrycznych). Większy wybór oferuje MATLAB, jednak należy | |||
bezwzględnie pamiętać o jednym: nie ma uniwersalnej metody reorderingu i dla | |||
konkretnej macierzy może istnieć specjalna metoda, która da oszałamiające | |||
rezultaty, podczas gdy standardowe podejścia nie dadzą efektu. | |||
<div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | <div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | ||
<span style="font-variant:small-caps;">Przykład: | <span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Rozwiązywanie układu z macierzą rozrzedzoną w Octave</span> | ||
<div class="solution"> | <div class="solution" style="margin-left,margin-right:3em;"> | ||
Najprostszy sposób na wykorzystanie metody bezpośredniego rozwiązywania układu z macierzą rzadką to zastosowanie znanego nam operatora do macierzy typu rozrzedzonego: | |||
<div style="margin: 1em; padding:1em; color: #006; background-color:#fcfcfc;"><pre>A = sparse(...); | |||
x = A \ b; | |||
</pre></div> | |||
Octave domyślnie przyłoży do <math>\displaystyle A</math> reordering <code style="color: #006">colamd</code> i następnie skorzysta z biblioteki UMFPACK, by rozwiązać taki układ. Dodatkowo, badane jest wcześniej, czy macierz nie jest przypadkiem taśmowa o wąskiej wstędze: jeśli jest, to korzysta się z LAPACKa. | |||
(Jak widzisz, operator rozwiązywania układu równań jest mocno przeciążony: działa i na macierzach kwadratowych, i na prostokątnych, i na rozrzedzonych --- na każdym rodzaju w inny sposób. Nie dziwi Cię chyba, dlaczego wygodnie było napisać Octave w C++?) | |||
</div></div> | |||
<div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | |||
<span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Wypełnienie pewnej macierzy w zależności od użytego reorderingu</span> | |||
<div class="solution" style="margin-left,margin-right:3em;"> | |||
[ | Rozważmy ponownie macierz pochodzącą z kolekcji [http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/matrices/Boeing Tima Davisa]. Jest to macierz symetryczna, dodatnio określona, wymiaru 8032, o 355460 elementach niezerowych i, w konsekwencji, o wypełnieniu około 0.6 procent. | ||
[[Image:MNsparseA.png|thumb|550px|center|Struktura niezerowych elementów macierzy.]] | |||
elementów | |||
Zobaczymy, jak w zależności od użytego algorytmu permutacji kolumn i | Zobaczymy, jak w zależności od użytego algorytmu permutacji kolumn i | ||
wierszy poradzi sobie algorytm rozkładu Cholesky'ego. | wierszy poradzi sobie algorytm rozkładu Cholesky'ego. | ||
[[Image:MNsparsechol.png|thumb| | [[Image:MNsparsechol.png|thumb|550px|center|Czynnik rozkładu Cholesky'ego <math>\displaystyle L</math> wykonanego | ||
standardowym algorytmem. Czas rozkładu: 0.892013]] | standardowym algorytmem. Czas rozkładu: 0.892013]] | ||
[[Image:MNsparsecholcolamd.png|thumb| | [[Image:MNsparsecholcolamd.png|thumb|550px|center|Czynnik rozkładu Cholesky'ego <math>\displaystyle L</math> z reorderingiem | ||
COLAMD. Czas rozkładu: 0.813038]] | COLAMD. Czas rozkładu: 0.813038]] | ||
[[Image:MNsparsecholsymamd.png|thumb| | [[Image:MNsparsecholsymamd.png|thumb|550px|center|Czynnik rozkładu Cholesky'ego <math>\displaystyle L</math> z reorderingiem | ||
SYMAMD. Czas rozkładu: 0.487683s. Prawie dwa razy | SYMAMD. Czas rozkładu: 0.487683s. Prawie dwa razy | ||
szybciej niż bez reorderingu, chociaż i tak wskutek wzrostu wypełnienia macierzy | szybciej niż bez reorderingu, chociaż i tak wskutek wzrostu wypełnienia macierzy | ||
w dolnym trójkącie mamy aż 2 procent niezerowych elementów.]] | w dolnym trójkącie mamy aż 2 procent niezerowych elementów.]] | ||
[[Image:MNsparsecholsymrcm.png|thumb| | [[Image:MNsparsecholsymrcm.png|thumb|550px|center|Czynnik rozkładu Cholesky'ego <math>\displaystyle L</math> z odwrotnym reorderingiem | ||
Cuthill-McKee. Czas rozkładu: 0.845928]] | Cuthill-McKee. Czas rozkładu: 0.845928]] | ||
[[Image:MNsparsecholcolperm.png|thumb| | [[Image:MNsparsecholcolperm.png|thumb|550px|center|Czynnik rozkładu Cholesky'ego <math>\displaystyle L</math> z jeszcze | ||
innym (bardzo tanim, ale jak widać czasem zupełnie złym) reorderingiem. Czas rozkładu: 5.947936]] | innym (bardzo tanim, ale jak widać czasem zupełnie złym) reorderingiem. Czas rozkładu: 5.947936]] | ||
Na zakończenie popatrzmy, jak ważne jest spostrzeżenie symetrii macierzy: | Na zakończenie popatrzmy, jak ważne jest spostrzeżenie symetrii macierzy: | ||
[[Image:MNsparseLlu.png|thumb| | [[Image:MNsparseLlu.png|thumb|550px|center|Rozkład LU, czynnik <math>\displaystyle L</math> (bez reorderingu). Czas rozkładu LU: 1.696018s. Nieakceptowalny, podobnie | ||
jak drastyczne wypełnienie macierzy.]] | jak drastyczne wypełnienie macierzy.]] | ||
[[Image:MNsparseUlu.png|thumb| | [[Image:MNsparseUlu.png|thumb|550px|center|Rozkład LU, czynnik <math>\displaystyle U</math> (bez reorderingu)]] | ||
Jak widać, w naszym przypadku standardowe algorytmy (COLAMD i SYMAMD) poradziły sobie całkiem | Jak widać, w naszym przypadku standardowe algorytmy (COLAMD i SYMAMD) poradziły sobie całkiem nieźle, chociaż wypełnienie i tak znacząco wzrosło. Zapewne, dla tej macierzy, która jest specyficznego typu --- pochodzi z dyskretyzacji równania różniczkowego --- algorytm ND mógłby tu jeszcze lepiej zadziałać. | ||
nieźle, chociaż wypełnienie i tak znacząco wzrosło. Zapewne algorytm | |||
</div></div> | </div></div> | ||
Linia 335: | Linia 351: | ||
==Stacjonarne metody iteracyjne== | ==Stacjonarne metody iteracyjne== | ||
Gdy macierz jest rozrzedzona, mnożenie takiej macierzy przez wektor jest tanie | Gdy macierz jest rozrzedzona, mnożenie takiej macierzy przez wektor jest bardzo tanie (koszt jest proporcjonalny do liczby niezerowych elementów macierzy). | ||
(koszt jest proporcjonalny do liczby | Dlatego, jeśli możemy zadowolić się <strong>rozwiązaniem przybliżonym</strong> układu, a w zamian osiągnąć je tanim kosztem, warto rozważyć metody iteracyjne. | ||
Dlatego, jeśli możemy zadowolić się rozwiązaniem przybliżonym układu, a w zamian | |||
osiągnąć je tanim kosztem, warto rozważyć metody iteracyjne. | |||
Najprostsze metody iteracyjne (najprostsze w analizie i implementacji, ale --- | Najprostsze metody iteracyjne (najprostsze w analizie i implementacji, ale --- | ||
Linia 354: | Linia 368: | ||
</math></center> | </math></center> | ||
i zastosować doń [[ | i zastosować doń [[MN02#Iteracja prosta Banacha|metodę iteracji prostej Banacha]]: | ||
<center><math>\displaystyle x_{k+1} = M^{-1}(Zx_k + b). | <center><math>\displaystyle x_{k+1} = M^{-1}(Zx_k + b). | ||
</math></center> | </math></center> | ||
Takie metody nazywamy stacjonarnymi metodami iteracyjnymi. | Takie metody nazywamy stacjonarnymi metodami iteracyjnymi. Aby przeanalizować zbieżność takiej metody, warto rozpatrzyć przypadek ogólniejszy | ||
Aby przeanalizować zbieżność takiej metody, warto rozpatrzyć | |||
przypadek ogólniejszy | |||
<center><math>\displaystyle | <center><math>\displaystyle | ||
Linia 368: | Linia 379: | ||
</math></center> | </math></center> | ||
dla pewnej macierzy <math>\displaystyle B</math> | dla pewnej macierzy <math>\displaystyle B</math> oraz wektora <math>\displaystyle c</math>. (Dla stacjonarnej metody iteracyjnej, <math>\displaystyle B=M^{-1}Z</math> oraz <math>\displaystyle c=M^{-1}b</math>.) | ||
<math>\displaystyle c</math> ( | |||
W tym przypadku | W tym przypadku | ||
Linia 386: | Linia 396: | ||
zbieżności tej iteracji dla dowolnego wektora startowego <math>\displaystyle x_0</math> jest | zbieżności tej iteracji dla dowolnego wektora startowego <math>\displaystyle x_0</math> jest | ||
<center><math>\displaystyle \rho = \max\{ |\lambda| : \lambda \mbox{ jest wartością własną } | <center><math>\displaystyle \rho = \max\{ |\lambda| : \lambda \mbox{ jest wartością własną } B\} < 1. | ||
</math></center> | </math></center> | ||
Linia 392: | Linia 402: | ||
<math>\displaystyle \rho</math>. | <math>\displaystyle \rho</math>. | ||
Zaletą stacjonarnych metod iteracyjnych jest również ich prostota, | |||
przez co są one łatwe do zaprogramowania, co łatwo zobaczyć na przykładach metod: [[#Metoda Jacobiego|Jacobiego]] i [[#Metoda Gaussa-Seidela|Gaussa--Seidela]], które teraz omówimy. | |||
===Metoda Jacobiego=== | |||
Biorąc <math>\displaystyle | Biorąc <math>\displaystyle M = \mbox{diag} (A)</math>, gdzie <math>\displaystyle \mbox{diag} (A)</math> jest macierzą diagonalną składającą się | ||
gdzie <math>\displaystyle diag(A)</math> jest macierzą diagonalną składającą się | |||
z wyrazów stojących na głównej przekątnej macierzy | z wyrazów stojących na głównej przekątnej macierzy | ||
<math>\displaystyle A</math>, układ <math>\displaystyle A x= b</math> jest równoważny układowi | <math>\displaystyle A</math>, układ <math>\displaystyle A x= b</math> jest równoważny układowi | ||
<center><math>\displaystyle | <center><math>\displaystyle M x = Z x + b, | ||
</math></center> | </math></center> | ||
Linia 408: | Linia 418: | ||
<center><math>\displaystyle x_k\,=\,B x_{k-1}\,+\, c, | <center><math>\displaystyle x_k\,=\,B x_{k-1}\,+\, c, | ||
</math></center> | </math></center> | ||
gdzie <math>\displaystyle B=- | gdzie <math>\displaystyle B=-M^{-1}Z</math> i <math>\displaystyle c=M^{-1} b</math>, zwaną | ||
<strong>metodą Jacobiego</strong>. | <strong>metodą Jacobiego</strong>. | ||
Rozpisując ją po współrzędnych dostajemy (numer iteracji wyjątkowo zaznaczamy w postaci ''górnego'' indeksu) układ rozszczepionych równań: | |||
<center><math>\displaystyle x^{(k)}_i = \frac{1}{a_{ii}} \left( b_i - \sum_{j\neq i} a_{ij}x^{(k-1)}_j \right), | |||
</math></center> | |||
co znaczy dokładnie tyle, że w <math>\displaystyle i</math>-tym równaniu wyjściowego układu przyjmujemy za współrzędne <math>\displaystyle x</math> wartości z poprzedniej iteracji i na tej podstawie wyznaczamy wartość <math>\displaystyle x_i</math>. | |||
{{twierdzenie|O zbieżności metody Jacobiego|O zbieżności metody Jacobiego| | |||
W metodzie Jacobiego warunek dostateczny zbieżności, | W metodzie Jacobiego warunek dostateczny zbieżności, | ||
Linia 421: | Linia 440: | ||
</math></center> | </math></center> | ||
Rzeczywiście, ponieważ wyraz <math>\displaystyle (i,j)</math> macierzy <math>\displaystyle | }} | ||
{{dowod||| | |||
Rzeczywiście, ponieważ wyraz <math>\displaystyle (i,j)</math> macierzy <math>\displaystyle M^{-1}Z</math> | |||
wynosi <math>\displaystyle 0</math> dla <math>\displaystyle i=j</math> oraz <math>\displaystyle a_{i,j}/a_{i,i}</math> dla <math>\displaystyle i\neq j</math>, a więc | wynosi <math>\displaystyle 0</math> dla <math>\displaystyle i=j</math> oraz <math>\displaystyle a_{i,j}/a_{i,i}</math> dla <math>\displaystyle i\neq j</math>, a więc | ||
<center><math>\displaystyle \aligned \lefteqn{\| | <center><math>\displaystyle \aligned \lefteqn{\|M^{-1}Z\|_\infty \;=\; \max_{1\le i\le N} | ||
\sum_{j=1,j\ne i}^N{|a_{i,j}|}/{|a_{i,i}|} } \\ | \sum_{j=1,j\ne i}^N{|a_{i,j}|}/{|a_{i,i}|} } \\ | ||
&& =\;\max_{1\le i\le N} | && =\;\max_{1\le i\le N} | ||
Linia 431: | Linia 453: | ||
przy czym ostatnia nierówność wynika z warunku diagonalnej dominacji. | przy czym ostatnia nierówność wynika z warunku diagonalnej dominacji. | ||
}} | |||
<div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | <div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | ||
<span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Macierz laplasjanu</span> | <span style="font-variant:small-caps;">Przykład: Macierz laplasjanu</span> | ||
<div class="solution"> | <div class="solution" style="margin-left,margin-right:3em;"> | ||
Macierz <math>\displaystyle N\times N</math>, zwana <strong>macierzą jednowymiarowego laplasjanu</strong> | Macierz <math>\displaystyle N\times N</math>, zwana <strong>macierzą jednowymiarowego laplasjanu</strong> | ||
Linia 448: | Linia 471: | ||
pojawia się w bardzo wielu zastosowaniach, także jako podzadanie w algorytmach | pojawia się w bardzo wielu zastosowaniach, także jako podzadanie w algorytmach | ||
numerycznych. Ta macierz jest macierzą taśmową, symetryczną i dodatnio | numerycznych. Ta macierz jest macierzą taśmową, symetryczną i dodatnio | ||
określoną, więc | określoną, więc układ równań z tą macierzą można bez trudu rozwiązać metodami | ||
bezpośrednimi, kosztem <math>\displaystyle O(N)</math>. Stosując do niej metodę Jacobiego mamy <math>\displaystyle M = 2I</math> oraz <math>\displaystyle Z = L - M</math>. Obliczając | |||
normę macierzy iteracji Jacobiego dostajemy <math>\displaystyle ||M^{-1}Z||_\infty | |||
= 1</math>, co nie rozstrzyga jeszcze o jej zbieżności lub niezbieżności. | |||
normę macierzy iteracji Jacobiego dostajemy <math>\displaystyle || | |||
= 1</math>, co nie rozstrzyga jeszcze o jej | |||
Okazuje się, że są | Potrzebna będzie bardziej subtelna analiza. Okazuje się, że są znane wzory na wartości własne macierzy <math>\displaystyle L</math>: | ||
<center><math>\displaystyle \lambda_j = 4\sin^2 \left(\frac{j \pi }{2(N+1)} \right), | <center><math>\displaystyle \lambda_j = 4\sin^2 \left(\frac{j \pi }{2(N+1)} \right), | ||
</math></center> | </math></center> | ||
dla <math>\displaystyle 1 \leq j \leq N.</math> | dla <math>\displaystyle 1 \leq j \leq N.</math> W konsekwencji, wartościami własnymi <math>\displaystyle M^{-1}Z = \frac{1}{2}Z = \frac{1}{2}L - I</math> są liczby <math>\displaystyle \mu_i = \frac{1}{2} \lambda_i - 1</math>. Ponieważ <math>\displaystyle 0 < \mu_i < 1</math>, znaczy to, że metoda Jacobiego jest zbieżna dla macierzy <math>\displaystyle L</math>. | ||
Z drugiej strony, nie dajmy się zwieść optymizmowi matematyka (''"nie martw się, jest zbieżny..."''): nietrudno sprawdzić, że <math>\displaystyle ||Z||_2 = 1 - O(N^{-2}) < 1</math>, co oznacza, że metoda Jacobiego --- choć zbieżna --- dla dużych <math>\displaystyle N</math> staje się | |||
zbieżna tak wolno, że w praktyce bezużyteczna! | |||
zbieżna tak wolno, że w praktyce bezużyteczna | |||
</div></div> | </div></div> | ||
===Metoda Gaussa-Seidela=== | |||
<!-- | |||
Ciekawostką jest, że Gauss nie miał z nią nic wspólnego, a Seidel był podobno jej przeciwnikiem... | |||
--> | |||
Heurystyka tej metody opiera się na zmodyfikowaniu metody Jacobiego tak, by w każdym momencie iteracji korzystać z najbardziej "aktualnych" współrzędnych przybliżenia rozwiązania <math>\displaystyle x</math>. | |||
Rzeczywiście, przecież rozwiązując równanie metody Jacobiego: | |||
<center><math>\displaystyle x^{(k)}_i = \frac{1}{a_{ii}} \left( b_i - \sum_{j\neq i} a_{ij}x^{(k-1)}_j \right), | |||
</math></center> | |||
nietrudno zauważyć, że w części sumy moglibyśmy odwoływać się do "dokładniejszych" wartości <math>\displaystyle x^{(k)}_j</math>: dla <math>\displaystyle j < i</math>, tzn. | |||
<center><math>\displaystyle x^{(k)}_i = \frac{1}{a_{ii}} \left( b_i - \sum_{j< i} a_{ij}x^{(k)}_j - \sum_{j>i} a_{ij}x^{(k-1)}_j \right). | |||
</math></center> | |||
W języku rozkładu macierzy <math>\displaystyle A = M - Z</math> i iteracji <math>\displaystyle x_{k+1} = M^{-1}(Zx_k + b)</math> mamy więc <math>\displaystyle M = \mbox{tril} (A)</math> (dolny trójkąt macierzy <math>\displaystyle A</math>). | |||
{{twierdzenie|O zbieżności metody Gaussa-Seidela|O zbieżności metody Gaussa-Seidela| | |||
Jeśli macierz <math>\displaystyle A</math> jest diagonalnie dominująca, to metoda Gaussa--Seidela jest zbieżna dla dowolnego wektora startowego <math>\displaystyle x_0</math>. | |||
}} | |||
Inny wariant tej metody dostalibyśmy, biorąc za <math>\displaystyle M</math> górny trójkąt macierzy <math>\displaystyle A</math>. | |||
Metoda Gaussa--Seidela jest w wielu przypadkach rzeczywiście szybciej zbieżna od metody Jacobiego, np. tak jest w przypadku macierzy jednowymiarowego Laplasjanu. Wciąż jednak, dodajmy, dla zadań bardzo źle uwarunkowanych jej zbieżność jest zbyt wolna by ją stosować jako samodzielną metodę. | |||
<div style="margin-top:1em; padding-top,padding-bottom:1em;"> | |||
<span style="font-variant:small-caps;">Uwaga</span> | |||
<div class="solution" style="margin-left,margin-right:3em;"> | |||
Obie metody, Jacobiego i (zwłaszcza) Gaussa--Seidela stosuje się także czasem w prostych algorytmach rozwiązywania <strong>układów równań nieliniowych</strong>: ich zaletą jest to, że głównym składnikiem iteracji jest rozwiązywanie [[MN02|<strong>skalarnego</strong> równania nieliniowego]] na każdym kroku metody. | |||
</div></div> | |||
Zastanówmy się teraz nad złożonością metod | ===Złożoność stacjonarnych metod iteracyjnych=== | ||
iteracyjnych. Ponieważ możemy jedynie znaleźć pewne | |||
przybliżenie rozwiązania dokładnego <math>\displaystyle x^*</math>, przez | Zastanówmy się teraz nad złożonością metod iteracyjnych. Ponieważ możemy jedynie znaleźć pewne przybliżenie rozwiązania dokładnego <math>\displaystyle x^*</math>, przez złożoność metody będziemy rozumieli koszt kombinatoryczny obliczenia <math>\displaystyle x_k</math> z zadaną dokładnością <math>\displaystyle \epsilon>0</math>. Dla uproszczenia założymy, że medoda jest zbieżna liniowo z ilorazem <math>\displaystyle \rho</math>. Zauważmy, że aby zredukować błąd początkowy do <math>\displaystyle \epsilon>0</math>, wystarczy wykonać <math>\displaystyle k=k(\epsilon)</math> iteracji, gdzie <math>\displaystyle k</math> spełnia | ||
złożoność metody będziemy rozumieli koszt | |||
kombinatoryczny obliczenia <math>\displaystyle x_k</math> z zadaną | |||
dokładnością <math>\displaystyle \epsilon>0</math>. Dla uproszczenia założymy, | |||
że medoda jest zbieżna liniowo z ilorazem <math>\displaystyle \rho</math>. | |||
Zauważmy, że aby zredukować błąd początkowy do | |||
<math>\displaystyle \epsilon>0</math>, wystarczy wykonać <math>\displaystyle k=k(\epsilon)</math> iteracji, gdzie | |||
<math>\displaystyle k</math> spełnia | |||
<center><math>\displaystyle \rho^k\| x_0- x^*\|\,\le\,\epsilon, | <center><math>\displaystyle \rho^k\| x_0- x^*\|\,\le\,\epsilon, | ||
Linia 493: | Linia 532: | ||
czyli | czyli | ||
<center><math>\displaystyle k\,\ge\,\frac{\log(1/\epsilon)- | <center><math>\displaystyle k\,\ge\,\frac{\log(1/\epsilon) - \log(1/\| x_0- x^*\|)}{\log(1/\rho)}. | ||
</math></center> | </math></center> | ||
Liczba ta zależy więc w istotny sposób od błędu | Liczba ta zależy więc w istotny sposób od błędu początkowego i (przede wszystkim) od współczynnika redukcji błędu <math>\displaystyle \rho</math>, natomiast zależność od dokładności <math>\displaystyle \epsilon</math> i wymiaru <math>\displaystyle N</math> układu jest dużo mniej istotna (w zadaniach praktycznych -- takich jak jednowymiarowy laplasjan --- jednak często | ||
początkowego i (przede wszystkim) od współczynnika redukcji błędu | |||
<math>\displaystyle \rho</math>, natomiast zależność od dokładności <math>\displaystyle \epsilon</math> | |||
i wymiaru <math>\displaystyle N</math> układu jest dużo mniej istotna (w zadaniach praktycznych -- takich jak jednowymiarowy laplasjan --- jednak | |||
często | |||
okazuje się, że... <math>\displaystyle \rho</math> zależy od <math>\displaystyle N</math>!). | okazuje się, że... <math>\displaystyle \rho</math> zależy od <math>\displaystyle N</math>!). | ||
Zakładając, że koszt jednej iteracji wynosi <math>\displaystyle c=c(N)</math> | Zakładając, że koszt jednej iteracji wynosi <math>\displaystyle c=c(N)</math> (<math>\displaystyle c(N)</math> jest tym mniejszy, im mniejsza jest liczba niezerowych elementów macierzy <math>\displaystyle A</math>), złożoność metody jest proporcjonalna do | ||
(<math>\displaystyle c(N)</math> jest tym mniejszy, im mniejsza jest liczba | |||
niezerowych elementów macierzy <math>\displaystyle A</math>), złożoność | |||
metody jest proporcjonalna do | |||
<center><math>\displaystyle c(N)\,\frac{\log(1/\epsilon)}{\log(1/\rho)}. | <center><math>\displaystyle c(N)\,\frac{\log(1/\epsilon)}{\log(1/\rho)}. | ||
</math></center> | </math></center> | ||
Stąd oczywisty wniosek, że metody iteracyjne warto | Stąd oczywisty wniosek (prawdziwy nie tylko dla metod stacjonarnych), że metody iteracyjne warto stosować zamiast metod bezpośrednich w przypadku, gdy | ||
stosować zamiast metod bezpośrednich w przypadku, gdy | |||
* wymiar <math>\displaystyle N</math> układu <math>\displaystyle A x= b</math> jest "duży", oraz | * wymiar <math>\displaystyle N</math> układu <math>\displaystyle A x= b</math> jest "duży", oraz | ||
* macierz <math>\displaystyle A</math> układu jest "rozrzedzona", tzn. ma stosunkowo niewielką liczbę elementów niezerowych, np. proporcjonalną do <math>\displaystyle N</math>. | * macierz <math>\displaystyle A</math> układu jest "rozrzedzona", tzn. ma stosunkowo niewielką liczbę elementów niezerowych, np. proporcjonalną do <math>\displaystyle N</math>. | ||
Układy o tych własnościach powstają często przy | Układy o tych własnościach powstają często przy numerycznym rozwiązywaniu równań różniczkowych cząstkowych. | ||
numerycznym rozwiązywaniu równań różniczkowych | |||
cząstkowych. | |||
==Metody przestrzeni Kryłowa== | ==Metody przestrzeni Kryłowa== | ||
Zupełnie inny pomysł na realizację metody iteracyjnej przedstawiają metody przestrzeni | Zupełnie inny pomysł na realizację metody iteracyjnej przedstawiają metody przestrzeni Kryłowa, gdzie kolejne przybliżenie <math>\displaystyle x_k</math> dobiera się w taki sposób, by minimalizowało pewną miarę błędu na podprzestrzeni Kryłowa | ||
Kryłowa, gdzie kolejne przybliżenie <math>\displaystyle x_k</math> dobiera się w taki sposób, by | |||
minimalizowało pewną miarę błędu na podprzestrzeni Kryłowa | |||
<center><math>\displaystyle K_k = \mbox{span} \{r,A_r,\ldots, A^{k-1}r \}, | <center><math>\displaystyle K_k = \mbox{span} \{r,A_r,\ldots, A^{k-1}r \}, | ||
</math></center> | </math></center> | ||
gdzie <math>\displaystyle r = b-Ax_0</math> jest residuum na początku iteracji. W zależności od wyboru | gdzie <math>\displaystyle r = b-Ax_0</math> jest ''residuum'' na początku iteracji. (Zwróć uwagę, że przestrzeń Kryłowa jest rozpięta przez kolejne wektory [[MN13#Metoda potęgowa|metody potęgowej]]] --- to nie przypadek!). W zależności od wyboru sposobu miary błędu, dostajemy inną metodę iteracyjną, takie jak CG, GMRES, PCR, BiCG, i inne. Tutaj omówimy pokrótce tylko najpopularniejszą: CG. | ||
sposobu miary błędu, dostajemy inną metodę iteracyjną, takie jak CG, GMRES, PCR, | |||
BiCG, i inne. Tutaj omówimy pokrótce tylko | |||
===CG=== | |||
Metoda <strong>gradientów sprzężonych</strong> ''conjugate gradients | Metoda <strong>gradientów sprzężonych</strong>, w skrócie CG (''conjugate gradients''), działa przy założeniu, że <math>\displaystyle A</math> jest <strong>symetryczna i dodatnio określona</strong>. | ||
Kolejne przybliżenie <math>\displaystyle x_k</math> ma minimalizować błąd w normie energetycznej | Kolejne przybliżenie <math>\displaystyle x_k</math> ma minimalizować błąd w normie energetycznej | ||
Linia 546: | Linia 570: | ||
na przestrzeni afinicznej <math>\displaystyle x_0 + K_k</math>. Okazuje się (co ''nie jest'' oczywiste --- trzeba skorzystać z rozmaitych własności ortogonalności generowanych wektorów), że takie zadanie minimalizacji daje się bardzo efektywnie rozwiązać, skąd dostajemy bardzo zwarty algorytm: | na przestrzeni afinicznej <math>\displaystyle x_0 + K_k</math>. Okazuje się (co ''nie jest'' oczywiste --- trzeba skorzystać z rozmaitych własności ortogonalności generowanych wektorów), że takie zadanie minimalizacji daje się bardzo efektywnie rozwiązać, skąd dostajemy bardzo zwarty algorytm: | ||
{{algorytm||| | {{algorytm|Metoda CG|Metoda CG| | ||
<pre> | <pre>r = b-A*x; | ||
r = b-A*x; | <math>\displaystyle \rho_0</math> = <math>\displaystyle ||r||_2^2</math>; <math>\displaystyle \beta</math> = 0; k = 1; | ||
while (!stop) | |||
while | |||
{ | { | ||
p = r + <math>\displaystyle \beta</math>*p; | p = r + <math>\displaystyle \beta</math>*p; | ||
w = A*p; | w = A*p; | ||
<math>\displaystyle \alpha</math> = <math>\displaystyle | <math>\displaystyle \alpha</math> = <math>\displaystyle \rho_{k-1}</math>/<math>\displaystyle p^Tw</math>; | ||
x = x + <math>\displaystyle \alpha</math>*p; | x = x + <math>\displaystyle \alpha</math>*p; | ||
r = r - <math>\displaystyle \alpha</math>*w; | r = r - <math>\displaystyle \alpha</math>*w; | ||
Linia 565: | Linia 588: | ||
Jak widać, całą iterację da się wykonać przechowując w pamięci tylko kilka wektorów (a nie, jak możnaby się obawiać, całą przestrzeń <math>\displaystyle K_k</math>), a najdroższym jej elementem jest mnożenie macierzy przez wektor. | Jak widać, całą iterację da się wykonać przechowując w pamięci tylko kilka wektorów (a nie, jak możnaby się obawiać, całą przestrzeń <math>\displaystyle K_k</math>), a najdroższym jej elementem jest mnożenie macierzy przez wektor. | ||
{{twierdzenie| | {{twierdzenie|O zbieżności CG jako metody bezpośredniej|O zbieżności CG jako metody bezpośredniej| | ||
Niech <math>\displaystyle A\in R^{N\times N}</math> będzie symetryczna i dodatnio określona. Algorytm CG znajdzie dokładne rozwiązanie po co najwyżej <math>\displaystyle N</math> iteracjach. | Niech <math>\displaystyle A\in R^{N\times N}</math> będzie symetryczna i dodatnio określona. Algorytm CG znajdzie dokładne rozwiązanie po co najwyżej <math>\displaystyle N</math> iteracjach. | ||
Linia 572: | Linia 595: | ||
Powyższe twierdzenie, choć teoretycznie interesujące, ma małą wartość praktyczną z dwóch powodów: | Powyższe twierdzenie, choć teoretycznie interesujące, ma małą wartość praktyczną z dwóch powodów: | ||
* dla bardzo dużych <math>\displaystyle N</math>, wykonanie <math>\displaystyle N</math> iteracji może być wciąż zbyt kosztownym zadaniem; | * dla bardzo dużych <math>\displaystyle N</math>, wykonanie <math>\displaystyle N</math> iteracji może być wciąż zbyt kosztownym zadaniem; | ||
* ponieważ w arytmetyce | * ponieważ w arytmetyce skończonej precyzji ortogonalność --- z której w bardzo istotny sposób korzysta się przy wyprowadzeniu algorytmu --- pogarsza się z iteracji na iterację i w konsekwencji, po wielu iteracjach, jakość <math>\displaystyle x_k</math> przestaje się poprawiać. | ||
Dlatego wygodniej potraktować CG jako metodę iteracyjną. Zachodzi bowiem | Dlatego wygodniej potraktować CG jako metodę iteracyjną. Zachodzi bowiem | ||
{{twierdzenie|Zbieżność CG jako metody iteracyjnej|| | {{twierdzenie|Zbieżność CG jako metody iteracyjnej|Zbieżność CG jako metody iteracyjnej| | ||
Po <math>\displaystyle k</math> iteracjach metody CG, | Po <math>\displaystyle k</math> iteracjach metody CG, | ||
Linia 586: | Linia 609: | ||
}} | }} | ||
Metoda GMRES ''Generalized Minimum RESidual ''nie wymaga ani symetrii, ani dodatniej określoności macierzy, jest więc bardziej uniwersalna, choć też bardziej kosztowna od CG. | ===GMRES=== | ||
Metoda GMRES (''Generalized Minimum RESidual'') nie wymaga ani symetrii, ani dodatniej określoności macierzy, jest więc bardziej uniwersalna, choć też bardziej kosztowna od CG. Jej szczegółowe omówienie, w tym --- oszacowania szybkości zbieżności --- wykracza niestety poza ramy niniejszego wykładu. | |||
=== | ===Ściskanie macierzy=== | ||
Zbieżność wszystkich poznanych metod iteracyjnych zależy od własności | Zbieżność wszystkich poznanych metod iteracyjnych zależy od własności | ||
spektralnych macierzy układu. | spektralnych macierzy układu. Pojawiające się w zastosowaniach macierze | ||
mają niekorzystne własności spektralne (np. bardzo duży wskaźnik uwarunkowania), | często mają niekorzystne własności spektralne (np. bardzo duży wskaźnik uwarunkowania), przez co metody iteracyjne zbiegają na nich bardzo wolno. | ||
przez co metody iteracyjne zbiegają na nich bardzo wolno. | |||
Dlatego bardzo korzystne może być wstępne przetransformowanie układu | Dlatego bardzo korzystne może być wstępne przetransformowanie układu | ||
Linia 603: | Linia 627: | ||
<center><math>\displaystyle MAx = Mb, | <center><math>\displaystyle MAx = Mb, | ||
</math></center> | </math></center> | ||
gdzie macierz <math>\displaystyle MA</math> ma znacznie korzystniejsze własności z punktu widzenia | gdzie macierz <math>\displaystyle MA</math> ma znacznie korzystniejsze własności z punktu widzenia używanej metody iteracyjnej. W przypadku macierzy symetrycznych widzieliśmy, że kluczowe znaczenie dla zbieżności metody miał rozkład wartości własnych: jeśli wartości własne były bardzo rozrzucone po prostej, to uwarunkowanie było bardzo duże i w konsekwencji zbieżność powolna. Aby zbieżność była szybsza, kluczowe jest, by: | ||
używanej metody | * wartości własne <math>\displaystyle MA</math> były upakowane w klastrach | ||
iteracyjnej. | * najlepiej wszystkie w (małym) otoczeniu wartości 1 | ||
Taką operację nazywamy <strong> | |||
Jeśli więc chcielibyśmy przekształcić macierz tak, by metoda iteracyjna dla <math>\displaystyle MA</math> zbiegała szybko, musimy w jakiś sposób "ścisnąć" spektrum macierzy <math>\displaystyle A</math> w okolice jedności. Taką operację nazywamy <strong>ściskaniem</strong> (''preconditioning''), a macierz <math>\displaystyle M</math> --- <strong>imadłem</strong>. | |||
Aby całość miała sens, macierz | Aby całość miała sens, macierz ściskająca <math>\displaystyle M</math> powinna: | ||
* być łatwa w konstrukcji, | * być łatwa w konstrukcji, | ||
* być tania w mnożeniu przez wektor (głównym elementem każdej metody | * być tania w mnożeniu przez wektor (głównym elementem każdej metody iteracyjnej jest mnożenie macierzy przez wektor: <math>\displaystyle M\cdot (A \cdot x)</math>), | ||
iteracyjnej jest mnożenie macierzy przez wektor: <math>\displaystyle M\cdot (A \cdot x)</math>), | * macierz <math>\displaystyle MA</math> powinna mieć znacznie korzystniejsze własności z punktu widzenia używanej metody iteracyjnej. | ||
* macierz <math>\displaystyle MA</math> powinna mieć znacznie korzystniejsze własności z punktu widzenia | |||
używanej metody | |||
iteracyjnej. | |||
Kilka ekstremalnych propozycji na macierz | Kilka ekstremalnych propozycji na macierz imadła to <math>\displaystyle M = I</math> (łatwa w | ||
konstrukcji i tania w mnożeniu, ale nic | konstrukcji i tania w mnożeniu, ale niestety nic nie polepsza...) oraz | ||
<math>\displaystyle M=A^{-1}</math> (rewelacyjnie poprawia zbieżność metody iteracyjnej, dając zbieżność | <math>\displaystyle M=A^{-1}</math> (rewelacyjnie poprawia zbieżność metody iteracyjnej, dając zbieżność | ||
w jednej iteracji, ale bardzo droga w konstrukcji i mnożeniu). Widać więc, że | w jednej iteracji, ale bardzo droga w konstrukcji i mnożeniu). Widać więc, że | ||
Linia 626: | Linia 647: | ||
macierzy odwrotnej. | macierzy odwrotnej. | ||
Dlatego jednym z powszechniej stosowanych | Dlatego jednym z powszechniej stosowanych (aczkolwiek wciąż nie najbardziej skutecznych) sposobów ściskania są te oparte na zastosowaniu jednego kroku klasycznej metody iteracyjnej. | ||
zastosowaniu jednego kroku klasycznej metody iteracyjnej. | |||
[[Image:MNpcgconv.png|thumb| | [[Image:MNpcgconv.png|thumb|550px|center|Zbieżność metody CG bez żadnego ściskania oraz ściśniętej | ||
opartym na jednej iteracji (blokowej) metody Jacobiego.]] | imadłem opartym na jednej iteracji (blokowej) metody Jacobiego.]] | ||
Inne | Inne sposoby ściśnięcia macierzy wykorzystują np. techniki tzw. <strong>niepełnego | ||
albo --- w specyficznych przypadkach --- tzw. metody wielosiatkowe. | rozkładu</strong> macierzy, albo --- w specyficznych przypadkach --- tzw.<strong> metody | ||
wielosiatkowe</strong>. | |||
Okazuje się, że zarówno CG jak i GMRES da się zaimplementować tak, by w jednej | Okazuje się, że zarówno CG jak i GMRES da się zaimplementować tak, by w jednej | ||
iteracji było konieczne tylko jedno mnożenie przez macierz | iteracji było konieczne tylko jedno mnożenie przez macierz imadła. | ||
==Literatura== | |||
W celu dogłębnego zapoznania się z omawianym na wykładzie materiałem, przeczytaj <b>rozdział 4.6 i 4.7</b> w | |||
* D. Kincaid, W. Cheney <cite>Analiza numeryczna</cite>, Wydawnictwa Naukowo-Techniczne, Warszawa 2006, ISBN 83-204-3078-X. | |||
Tym razem wymienione rozdziały nie wystarczą do dogłębnego zrozumienia omawianych treści. Warto więc sięgnąć po jeden z podręczników | |||
* <span style="font-variant:small-caps">C. T. Kelley</span>, <cite>Iterative Solution of Systems of Linear and Nonlinear Equations</cite>, SIAM, 1995, | |||
* <span style="font-variant:small-caps">Y. Saad</span>, <cite>[http://www-users.cs.umn.edu/ saad/books.html Iterative Methods for Sparse Linear Systems]</cite>, PWS, 1996. |
Wersja z 19:33, 29 wrz 2006
Wielkie układy równań liniowych
<<< Powrót do strony głównej przedmiotu Metody numeryczne
Wraz z coraz większymi modelami pojawiającymi się w praktyce obliczeniowej, coraz częściej zachodzi potrzeba rozwiązywania zadań algebry liniowej, w której macierze są co prawda wielkiego wymiaru, ale najczęściej rozrzedzone, to znaczy jest w nich bardzo dużo zer. Bardzo często zdarza się, że macierz wymiaru ma tylko niezerowych elementów. Wykorzytanie tej specyficznej własności macierzy nie tylko prowadzi do algorytmów istotnie szybszych od ich analogów dla macierzy gęstych (to znaczy takich, które (w założeniu) mają elementów), ale wręcz są jedynym sposobem na to, by niektóre zadania w ogóle stały się rozwiązywalne przy obecnym stanie techniki obliczeniowej!
Jednym ze szczególnie ważnych źródeł układów równań z macierzami rozrzedzonymi są np. równania różniczkowe cząstkowe (a więc np. modele pogody, naprężeń w konstrukcji samochodu, przenikania kosmetyków do głębszych warstw skóry, itp.).
Modele wielostanowych systemów kolejkowych (np. routera obsługującego wiele komputerów) także prowadzą do gigantycznych układów równań z macierzami rozrzedzonymi o specyficznej strukturze.
Z reguły zadania liniowe wielkiego wymiaru będą miały strukturę macierzy rozrzedzonej, gdyż najczęściej związki pomiędzy niewiadomymi w równaniu nie dotyczą wszystkich, tylko wybranej grupy.
Przykład: Macierz z kolekcji Boeinga
Spójrzmy na macierz sztywności dla modelu silnika lotniczego, wygenerowaną swego czasu w zakładach Boeinga i pochodzącą z dyskretyzacji pewnego równania różniczkowego cząstkowego. Pochodzi z kolekcji Tima Davisa. Jest to mała macierz, wymiaru 8032 (w kolekcji spotkasz równania z milionem i więcej niewiadomych).

Jej współczynnik wypełnienia (to znaczy, stosunek liczby niezerowych do wszystkich elementów macierzy) wynosi jedynie , a więc macierz jest bardzo rozrzedzona: w każdym wierszu są średnio tylko 44 niezerowe elementy.
Reprezentacja macierzy rzadkich
Zacznijmy od sposobu przechowywania macierzy rozrzedzonych. Naturalnie, nie ma sensu przechowywać wszystkich zerowych jej elementów: wystarczy ograniczyć się do zachowania tych niezerowych! W ten sposób zmniejszamy zarówno wymagania pamięciowe, jak i liczbę operacji zmiennoprzecinkowych potrzebnych do prowadzenia działań na macierzy (np. w przypadku mnożenia macierzy przez wektor, nie będziemy mnożyć przez zera!).
Format współrzędnych
Do zapamiętania macierzy wymiaru o niezerowych elementów wykorzystujemy trzy wektory: I
,
J
--- oba typu int
--- oraz V
, typu double
,
wszystkie o długości , przy czym

W tym formacie wprowadzane są macierze rzadkie do Octave'a i MATLABa:
A = sparse(I,J,V,N,N);
Jednak wewnętrznie przechowywane są w innym formacie, o którym poniżej.
Przykład
Pokażemy jak w Octave wprowadzić macierz rozrzedzoną.
Strukturę jej niezerowych elementów ukaże nam polecenie spy(A)
. Tak właśnie zostały wygenerowane obrazki macierzy w niniejszym wykładzie.
Format spakowanych kolumn (wierszy)
Format współrzędnych nie narzucał żadnego uporządkowania elementów macierzy --- można było je umieszczać w dowolnej kolejności. Narzucenie sensownego porządku mogłoby wspomóc realizację wybranych istotnych operacji na macierzy, na przykład, aby wygodnie było realizować działanie (prawostronnego) mnożenia macierzy przez wektor, dobrze byłoby przechowywać elementy macierzy wierszami. Tak właśnie jest zorganizowany format spakowanych wierszy (Compressed Sparse Row, CSR). Analogicznie jest zdefiniowany format spakowanych kolumn (Compressed Sparse Column, CSC), którym zajmiemy się bliżej.
Podobnie jak w przypadku formatu współrzędnych, macierz w formacie CSC jest
przechowywana w postaci trzech wektorów: AV
jest wektorem typu
double
o długości , zawierającym kolejne niezerowe elementy
macierzy wpisywane kolumnami, AI
jest wektorem typu int
o długości , zawierającym numery wierszy macierzy odpowiadających
elementom z AV
. Natomiast zamiast tablicy J
, jak to było w
formacie współrzędnych, mamy krótszy wektor typu int
, AP
, o
długości , zawierający na -tym miejscu indeks pozycji w AV
, od
którego rozpoczynają się w AV
elementy -tej kolumny macierzy .

Mamy więc zależność, przy założeniu, że ,
Taki (z drobnymi modyfikacjami) format macierzy wykorzystują np. pakiety ARPACK i UMFPACK (a także, wewnętrznie, Octave i MATLAB).
Format diagonalny
Znacznie mniej uniwersalny niż poprzednie i dlatego rzadziej spotykany. Kolejne diagonale macierzy przechowujemy w kolejnych wierszach macierzy , gdzie jest liczbą niezerowych diagonal w .
Szczególnie wygodny do reprezentacji macierzy taśmowych. Wykorzystywany m.in.
przez funkcję LAPACKa DGBSV
służącą rozwiązywaniu równań z macierzami
taśmowymi.
Uwagi praktyczne
Mnożenie macierzy w formacie AIJ przez wektor jest kilka razy wolniejsze w porównaniu do macierzy w formacie CSC/CSR (z tych dwóch oczywiście (dlaczego?) CSR jest najszybszy). Co więcej, okazuje się, że w typowych implementacjach, mnożenie macierzy rozrzedzonej (reprezentowanej np. w formacie CSC) przez wektor jest mało efektywne, mniej więcej na poziomie dziesięciu procent możliwości obliczeniowych procesora.
Jeśli już poważnie myśleć o przyspieszeniu mnożenia macierzy przez wektor (np. gdy chcemy stosować iteracyjną metodę rozwiązywania układu równań z tą macierzą), warto rozważyć inne formaty --- łączące w sobie podział macierzy na bloki (tak, jak w algorytmach BLAS) i przechowywanie (w zasadzie) tylko niezerowych elementów macierzy.
Macierze specjalne
Zajmiemy się teraz zadaniem rozwiązywania układu równań liniowych
ale w sytuacji, gdy macierz jest rozrzedzona i dużego wymiaru. Dokonamy przeglądu kilku rodzajów algorytmów mających na celu wykorzystanie rozrzedzenia macierzy dla obniżenia kosztu wyznaczenia rozwiązania układu.
Należy pamiętać, że z reguły najlepsze wyniki uzyskuje się, gdy konkretny algorytm dobierze się do konkretnej macierzy. W zastosowaniach pojawiają się m.in. macierze rzadkie o bardzo szczególnej strukturze, dla nich warto stosować wyspecjalizowane algorytmy.
Macierze taśmowe
Macierz taka, że dla , , nazywamy macierzą taśmową z rozstępem , o szerokości pasma .
Łatwo sprawdzić, że algorytm eliminacji Gaussa (bez wyboru elementu głównego) nie spowoduje dodatkowego wypełnienia w takiej macierzy (a więc da się wykonać w miejscu). W przypadku konieczności wyboru elementu głównego, pesymistyczne oszacowanie rozstępu macierzy rozkładu LU jest równe --- tak więc, dla niezbyt dużych wciąż wynikowa macierz jest taśmowa.
W szczególności, gdy macierz jest taśmowa z pasmem o rozstępie i jednocześnie diagonalnie dominująca, wtedy rozkład LU takiej macierzy da się wykonać w miejscu kosztem , czyli liniowym.
W LAPACKu zaimplementowano szybki solver równań z macierzami taśmowymi,
DGBSV
, ale wymagający specjalnego sposobu
przechowywania macierzy, wykorzystującego format diagonalny.
Macierze trójdiagonalne
Szczególnym przypadkiem macierzy taśmowych są macierze trójdiagonalne, tzn. taśmowe o rozstępie :
Zadanie rozwiązywania równań z taką macierzą
jest bardzo często spotykane, więc warto przytoczyć algorytm w całej okazałości --- popularnie zwany algorytmem przeganiania (niektóre źródła nazywają go algorytmem Thomasa).
Zacznijmy jednak od stwierdzenia, kiedy macierz trójdiagonalna nie wymaga wyboru elementu głównego:
Stwierdzenie
Jeśli macierz ma słabo dominującą diagonalę, tzn.
() i przynajmniej dla jednego indeksu "" mamy powyżej ostrą nierówność "", to algorytm przeganiania jest wykonalny bez przestawień wierszy. Ponadto wymaga on operacji arytmetycznych, a więc jest prawie optymalny.
Algorytm Metoda przeganiania
<math>\displaystyle d_1</math> = <math>\displaystyle a_1</math>; <math>\displaystyle f_1</math> = <math>\displaystyle e_1</math>; for (i = 2; i <= N; i++) { <math>\displaystyle l</math> = <math>\displaystyle b_i</math>/<math>\displaystyle a_{i-1}</math>; <math>\displaystyle d_i</math> = <math>\displaystyle a_i</math> - <math>\displaystyle l</math> * <math>\displaystyle c_{i-1}</math>; <math>\displaystyle f_i</math> = <math>\displaystyle e_i</math> - <math>\displaystyle l</math> * <math>\displaystyle f_{i-1}</math>; } <math>\displaystyle x_1</math> = <math>\displaystyle f_N</math>; for (i = N-1; i >= 1; i--) <math>\displaystyle x_i</math> = <math>\displaystyle f_i</math> - <math>\displaystyle c_i</math> * <math>\displaystyle x_{i+1}</math>;
Metody bezpośrednie
Przykład: Strzałka Wilkinsona
Rozważmy układ równań z macierzą diagonalnie dominującą postaci
gdzie oznacza jakiś niezerowy element. Łatwo sprawdzić, że chociaż wyjściowa macierz jest rozrzedzona, to zastosowanie do niej eliminacji Gaussa powoduje, że w wyniku dostajemy gęste czynniki rozkładu.
Tymczasem wystarczy odwrócić kolejność równań i numerację niewiadomych (co dla macierzy jest równoznaczne z odwróceniem porządku wierszy i kolumn, korzystając z pewnej (jakiej?) macierzy permutacji ):
Wtedy okazuje się, że rozkład naszej macierzy nie powoduje już wypełnienia czynników rozkładu!
Właśnie na tym polega główny problem w rozwiązywaniu układów z macierzami rzadkimi metodami bezpośrednimi: jak maksymalnie wykorzystać rozrzedzenie macierzy tak, by czynniki rozkładu były możliwie mało wypełnione. Albowiem wiedząc to będziemy mogli ograniczyć się jedynie do fizycznego wyznaczenia wartości niezerowych elementów macierzy rozkładu. Ponadto wymagania pamięciowe algorytmu nie będą istotnie wykraczać ponad ilość pamięci potrzebnej na przechowanie danych (tzn. macierzy).
W ogólnym przypadku rozwiązanie takiego zadania jest trudne i większość algorytmów opiera się na pewnych heurystykach, które jednak w praktyce warto wspomóc wcześniejszą analizą konkretnego układu równań jaki mamy rozwiązać. Najczęściej dąży się do takiego przenumerowania równań i niewiadomych, by w efekcie z góry przewidzieć, gdzie wystąpią zera w macierzach rozkładu --- i, by takich zer było jak najwięcej (by wypełnienie było jak najmniejsze)! Na architekturach z pamięcią hierarchiczną dąży się także do tego, by w trakcie rozkładu można było korzystać z BLAS Level 3, a więc permutacje wierszy i kolumn macierzy muszą to także brać pod uwagę.
Stosuje się kilka strategii wyznaczania korzystnych permutacji (reorderingu), z których warto wymienić
- przybliżone algorytmy minimalnego stopnia (approximate minimum degree, AMD), np. AMD;
- techniki podziału grafów na (prawie) rozłączne składowe nested dissection, ND, np. METIS.
Używają ich biblioteki takie jak UMFPACK, czy HSL.
W Octave mamy do dyspozycji także kilka procedur generujących takie permutacje, w tym: colamd
(AMD dla macierzy niesymetrycznych) oraz symamd
(AMD dla macierzy symetrycznych). Większy wybór oferuje MATLAB, jednak należy bezwzględnie pamiętać o jednym: nie ma uniwersalnej metody reorderingu i dla konkretnej macierzy może istnieć specjalna metoda, która da oszałamiające rezultaty, podczas gdy standardowe podejścia nie dadzą efektu.
Przykład: Rozwiązywanie układu z macierzą rozrzedzoną w Octave
Najprostszy sposób na wykorzystanie metody bezpośredniego rozwiązywania układu z macierzą rzadką to zastosowanie znanego nam operatora do macierzy typu rozrzedzonego:
A = sparse(...); x = A \ b;
Octave domyślnie przyłoży do reordering colamd
i następnie skorzysta z biblioteki UMFPACK, by rozwiązać taki układ. Dodatkowo, badane jest wcześniej, czy macierz nie jest przypadkiem taśmowa o wąskiej wstędze: jeśli jest, to korzysta się z LAPACKa.
(Jak widzisz, operator rozwiązywania układu równań jest mocno przeciążony: działa i na macierzach kwadratowych, i na prostokątnych, i na rozrzedzonych --- na każdym rodzaju w inny sposób. Nie dziwi Cię chyba, dlaczego wygodnie było napisać Octave w C++?)
Przykład: Wypełnienie pewnej macierzy w zależności od użytego reorderingu
Rozważmy ponownie macierz pochodzącą z kolekcji Tima Davisa. Jest to macierz symetryczna, dodatnio określona, wymiaru 8032, o 355460 elementach niezerowych i, w konsekwencji, o wypełnieniu około 0.6 procent.

Zobaczymy, jak w zależności od użytego algorytmu permutacji kolumn i wierszy poradzi sobie algorytm rozkładu Cholesky'ego.





Na zakończenie popatrzmy, jak ważne jest spostrzeżenie symetrii macierzy:


Jak widać, w naszym przypadku standardowe algorytmy (COLAMD i SYMAMD) poradziły sobie całkiem nieźle, chociaż wypełnienie i tak znacząco wzrosło. Zapewne, dla tej macierzy, która jest specyficznego typu --- pochodzi z dyskretyzacji równania różniczkowego --- algorytm ND mógłby tu jeszcze lepiej zadziałać.
Stacjonarne metody iteracyjne
Gdy macierz jest rozrzedzona, mnożenie takiej macierzy przez wektor jest bardzo tanie (koszt jest proporcjonalny do liczby niezerowych elementów macierzy). Dlatego, jeśli możemy zadowolić się rozwiązaniem przybliżonym układu, a w zamian osiągnąć je tanim kosztem, warto rozważyć metody iteracyjne.
Najprostsze metody iteracyjne (najprostsze w analizie i implementacji, ale --- jak można się domyślić --- w praktyce najmniej efektywne) polegają na rozkładzie macierzy na część "łatwo odwracalną", , i "resztę", . Dokładniej, jeśli jest nieosobliwa, to równanie można zapisać jako zadanie punktu stałego
gdzie . Inaczej:
i zastosować doń metodę iteracji prostej Banacha:
Takie metody nazywamy stacjonarnymi metodami iteracyjnymi. Aby przeanalizować zbieżność takiej metody, warto rozpatrzyć przypadek ogólniejszy
dla pewnej macierzy oraz wektora . (Dla stacjonarnej metody iteracyjnej, oraz .)
W tym przypadku
a stąd i z nierówności , mamy
Warunkiem dostatecznym zbieżności iteracji prostych jest więc . Okazuje się, że warunkiem koniecznym i dostatecznym zbieżności tej iteracji dla dowolnego wektora startowego jest
Tak więc, metody oparte na iteracji prostej będą zbieżne liniowo z ilorazem .
Zaletą stacjonarnych metod iteracyjnych jest również ich prostota, przez co są one łatwe do zaprogramowania, co łatwo zobaczyć na przykładach metod: Jacobiego i Gaussa--Seidela, które teraz omówimy.
Metoda Jacobiego
Biorąc , gdzie jest macierzą diagonalną składającą się z wyrazów stojących na głównej przekątnej macierzy , układ jest równoważny układowi
a stąd (o ile na przekątnej macierzy nie mamy zera) otrzymujemy metodę iteracyjną
gdzie i , zwaną metodą Jacobiego.
Rozpisując ją po współrzędnych dostajemy (numer iteracji wyjątkowo zaznaczamy w postaci górnego indeksu) układ rozszczepionych równań:
co znaczy dokładnie tyle, że w -tym równaniu wyjściowego układu przyjmujemy za współrzędne wartości z poprzedniej iteracji i na tej podstawie wyznaczamy wartość .
Twierdzenie O zbieżności metody Jacobiego
W metodzie Jacobiego warunek dostateczny zbieżności, , jest spełniony np. wtedy, gdy macierz ma dominującą przekątną, tzn. gdy
Dowód
Rzeczywiście, ponieważ wyraz macierzy wynosi dla oraz dla , a więc
przy czym ostatnia nierówność wynika z warunku diagonalnej dominacji.

Przykład: Macierz laplasjanu
Macierz , zwana macierzą jednowymiarowego laplasjanu
pojawia się w bardzo wielu zastosowaniach, także jako podzadanie w algorytmach numerycznych. Ta macierz jest macierzą taśmową, symetryczną i dodatnio określoną, więc układ równań z tą macierzą można bez trudu rozwiązać metodami bezpośrednimi, kosztem . Stosując do niej metodę Jacobiego mamy oraz . Obliczając normę macierzy iteracji Jacobiego dostajemy , co nie rozstrzyga jeszcze o jej zbieżności lub niezbieżności.
Potrzebna będzie bardziej subtelna analiza. Okazuje się, że są znane wzory na wartości własne macierzy :
dla W konsekwencji, wartościami własnymi są liczby . Ponieważ , znaczy to, że metoda Jacobiego jest zbieżna dla macierzy .
Z drugiej strony, nie dajmy się zwieść optymizmowi matematyka ("nie martw się, jest zbieżny..."): nietrudno sprawdzić, że , co oznacza, że metoda Jacobiego --- choć zbieżna --- dla dużych staje się zbieżna tak wolno, że w praktyce bezużyteczna!
Metoda Gaussa-Seidela
Heurystyka tej metody opiera się na zmodyfikowaniu metody Jacobiego tak, by w każdym momencie iteracji korzystać z najbardziej "aktualnych" współrzędnych przybliżenia rozwiązania .
Rzeczywiście, przecież rozwiązując równanie metody Jacobiego:
nietrudno zauważyć, że w części sumy moglibyśmy odwoływać się do "dokładniejszych" wartości : dla , tzn.
W języku rozkładu macierzy i iteracji mamy więc (dolny trójkąt macierzy ).
Twierdzenie O zbieżności metody Gaussa-Seidela
Jeśli macierz jest diagonalnie dominująca, to metoda Gaussa--Seidela jest zbieżna dla dowolnego wektora startowego .
Inny wariant tej metody dostalibyśmy, biorąc za górny trójkąt macierzy .
Metoda Gaussa--Seidela jest w wielu przypadkach rzeczywiście szybciej zbieżna od metody Jacobiego, np. tak jest w przypadku macierzy jednowymiarowego Laplasjanu. Wciąż jednak, dodajmy, dla zadań bardzo źle uwarunkowanych jej zbieżność jest zbyt wolna by ją stosować jako samodzielną metodę.
Uwaga
Obie metody, Jacobiego i (zwłaszcza) Gaussa--Seidela stosuje się także czasem w prostych algorytmach rozwiązywania układów równań nieliniowych: ich zaletą jest to, że głównym składnikiem iteracji jest rozwiązywanie skalarnego równania nieliniowego na każdym kroku metody.
Złożoność stacjonarnych metod iteracyjnych
Zastanówmy się teraz nad złożonością metod iteracyjnych. Ponieważ możemy jedynie znaleźć pewne przybliżenie rozwiązania dokładnego , przez złożoność metody będziemy rozumieli koszt kombinatoryczny obliczenia z zadaną dokładnością . Dla uproszczenia założymy, że medoda jest zbieżna liniowo z ilorazem . Zauważmy, że aby zredukować błąd początkowy do , wystarczy wykonać iteracji, gdzie spełnia
czyli
Liczba ta zależy więc w istotny sposób od błędu początkowego i (przede wszystkim) od współczynnika redukcji błędu , natomiast zależność od dokładności i wymiaru układu jest dużo mniej istotna (w zadaniach praktycznych -- takich jak jednowymiarowy laplasjan --- jednak często okazuje się, że... zależy od !).
Zakładając, że koszt jednej iteracji wynosi ( jest tym mniejszy, im mniejsza jest liczba niezerowych elementów macierzy ), złożoność metody jest proporcjonalna do
Stąd oczywisty wniosek (prawdziwy nie tylko dla metod stacjonarnych), że metody iteracyjne warto stosować zamiast metod bezpośrednich w przypadku, gdy
- wymiar układu jest "duży", oraz
- macierz układu jest "rozrzedzona", tzn. ma stosunkowo niewielką liczbę elementów niezerowych, np. proporcjonalną do .
Układy o tych własnościach powstają często przy numerycznym rozwiązywaniu równań różniczkowych cząstkowych.
Metody przestrzeni Kryłowa
Zupełnie inny pomysł na realizację metody iteracyjnej przedstawiają metody przestrzeni Kryłowa, gdzie kolejne przybliżenie dobiera się w taki sposób, by minimalizowało pewną miarę błędu na podprzestrzeni Kryłowa
gdzie jest residuum na początku iteracji. (Zwróć uwagę, że przestrzeń Kryłowa jest rozpięta przez kolejne wektory metody potęgowej] --- to nie przypadek!). W zależności od wyboru sposobu miary błędu, dostajemy inną metodę iteracyjną, takie jak CG, GMRES, PCR, BiCG, i inne. Tutaj omówimy pokrótce tylko najpopularniejszą: CG.
CG
Metoda gradientów sprzężonych, w skrócie CG (conjugate gradients), działa przy założeniu, że jest symetryczna i dodatnio określona.
Kolejne przybliżenie ma minimalizować błąd w normie energetycznej indukowanej przez ,
na przestrzeni afinicznej . Okazuje się (co nie jest oczywiste --- trzeba skorzystać z rozmaitych własności ortogonalności generowanych wektorów), że takie zadanie minimalizacji daje się bardzo efektywnie rozwiązać, skąd dostajemy bardzo zwarty algorytm:
Algorytm Metoda CG
r = b-A*x; <math>\displaystyle \rho_0</math> = <math>\displaystyle ||r||_2^2</math>; <math>\displaystyle \beta</math> = 0; k = 1; while (!stop) { p = r + <math>\displaystyle \beta</math>*p; w = A*p; <math>\displaystyle \alpha</math> = <math>\displaystyle \rho_{k-1}</math>/<math>\displaystyle p^Tw</math>; x = x + <math>\displaystyle \alpha</math>*p; r = r - <math>\displaystyle \alpha</math>*w; <math>\displaystyle \rho_k</math> = <math>\displaystyle ||r||_2^2</math>; <math>\displaystyle \beta</math> = <math>\displaystyle \frac{\rho_{k}}{\rho_{k-1}}</math>; k++; }
Jak widać, całą iterację da się wykonać przechowując w pamięci tylko kilka wektorów (a nie, jak możnaby się obawiać, całą przestrzeń ), a najdroższym jej elementem jest mnożenie macierzy przez wektor.
Twierdzenie O zbieżności CG jako metody bezpośredniej
Niech będzie symetryczna i dodatnio określona. Algorytm CG znajdzie dokładne rozwiązanie po co najwyżej iteracjach.
Powyższe twierdzenie, choć teoretycznie interesujące, ma małą wartość praktyczną z dwóch powodów:
- dla bardzo dużych , wykonanie iteracji może być wciąż zbyt kosztownym zadaniem;
- ponieważ w arytmetyce skończonej precyzji ortogonalność --- z której w bardzo istotny sposób korzysta się przy wyprowadzeniu algorytmu --- pogarsza się z iteracji na iterację i w konsekwencji, po wielu iteracjach, jakość przestaje się poprawiać.
Dlatego wygodniej potraktować CG jako metodę iteracyjną. Zachodzi bowiem
Twierdzenie Zbieżność CG jako metody iteracyjnej
Po iteracjach metody CG,
gdzie .
GMRES
Metoda GMRES (Generalized Minimum RESidual) nie wymaga ani symetrii, ani dodatniej określoności macierzy, jest więc bardziej uniwersalna, choć też bardziej kosztowna od CG. Jej szczegółowe omówienie, w tym --- oszacowania szybkości zbieżności --- wykracza niestety poza ramy niniejszego wykładu.
Ściskanie macierzy
Zbieżność wszystkich poznanych metod iteracyjnych zależy od własności spektralnych macierzy układu. Pojawiające się w zastosowaniach macierze często mają niekorzystne własności spektralne (np. bardzo duży wskaźnik uwarunkowania), przez co metody iteracyjne zbiegają na nich bardzo wolno.
Dlatego bardzo korzystne może być wstępne przetransformowanie układu
z macierzą o niekorzystnych własnościach, do układu
gdzie macierz ma znacznie korzystniejsze własności z punktu widzenia używanej metody iteracyjnej. W przypadku macierzy symetrycznych widzieliśmy, że kluczowe znaczenie dla zbieżności metody miał rozkład wartości własnych: jeśli wartości własne były bardzo rozrzucone po prostej, to uwarunkowanie było bardzo duże i w konsekwencji zbieżność powolna. Aby zbieżność była szybsza, kluczowe jest, by:
- wartości własne były upakowane w klastrach
- najlepiej wszystkie w (małym) otoczeniu wartości 1
Jeśli więc chcielibyśmy przekształcić macierz tak, by metoda iteracyjna dla zbiegała szybko, musimy w jakiś sposób "ścisnąć" spektrum macierzy w okolice jedności. Taką operację nazywamy ściskaniem (preconditioning), a macierz --- imadłem.
Aby całość miała sens, macierz ściskająca powinna:
- być łatwa w konstrukcji,
- być tania w mnożeniu przez wektor (głównym elementem każdej metody iteracyjnej jest mnożenie macierzy przez wektor: ),
- macierz powinna mieć znacznie korzystniejsze własności z punktu widzenia używanej metody iteracyjnej.
Kilka ekstremalnych propozycji na macierz imadła to (łatwa w konstrukcji i tania w mnożeniu, ale niestety nic nie polepsza...) oraz (rewelacyjnie poprawia zbieżność metody iteracyjnej, dając zbieżność w jednej iteracji, ale bardzo droga w konstrukcji i mnożeniu). Widać więc, że należy poszukiwać czegoś pośredniego, co niskim kosztem przybliża działanie macierzy odwrotnej.
Dlatego jednym z powszechniej stosowanych (aczkolwiek wciąż nie najbardziej skutecznych) sposobów ściskania są te oparte na zastosowaniu jednego kroku klasycznej metody iteracyjnej.

Inne sposoby ściśnięcia macierzy wykorzystują np. techniki tzw. niepełnego rozkładu macierzy, albo --- w specyficznych przypadkach --- tzw. metody wielosiatkowe.
Okazuje się, że zarówno CG jak i GMRES da się zaimplementować tak, by w jednej iteracji było konieczne tylko jedno mnożenie przez macierz imadła.
Literatura
W celu dogłębnego zapoznania się z omawianym na wykładzie materiałem, przeczytaj rozdział 4.6 i 4.7 w
- D. Kincaid, W. Cheney Analiza numeryczna, Wydawnictwa Naukowo-Techniczne, Warszawa 2006, ISBN 83-204-3078-X.
Tym razem wymienione rozdziały nie wystarczą do dogłębnego zrozumienia omawianych treści. Warto więc sięgnąć po jeden z podręczników
- C. T. Kelley, Iterative Solution of Systems of Linear and Nonlinear Equations, SIAM, 1995,
- Y. Saad, Iterative Methods for Sparse Linear Systems, PWS, 1996.